Protein–RNA interactions for Protein: A0A576

TCRBV9S1A1T, T-cell receptor beta variable 3-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV9S1A1TA0A576 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBV9S1A1TA0A576 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRBV9S1A1TA0A576 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms