Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQJ8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms