Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms