Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC093583.1-201ENST00000462083 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 BSND-201ENST00000371265 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC080112.4-201ENST00000623156 2491 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CDNF-202ENST00000378442 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NEFL-201ENST00000610854 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC139099.1-202ENST00000574098 2409 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CD300LF-202ENST00000326165 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DIO1-202ENST00000361921 1861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DNAJB8-202ENST00000469083 3365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RAD51C-201ENST00000337432 2591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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