Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NMUR2-201ENST00000255262 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TUBAL3-202ENST00000479328 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SNX16-203ENST00000396330 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 HSD3B1-201ENST00000369413 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ISG20L2-201ENST00000313146 3303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RASSF8-203ENST00000405154 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CCDC175-202ENST00000537690 2616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LILRA2-202ENST00000251377 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TAS1R1-202ENST00000351136 1871 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ZP1-201ENST00000278853 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PIK3R5-218ENST00000611902 4339 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 THAP1-201ENST00000254250 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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