Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RAD54L2Q9Y4B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAD54L2Q9Y4B4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms