Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIT1Q9Y3P8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms