Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL11Q9Y3B7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms