Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms