Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEU3Q9UQ49 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEU3Q9UQ49 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms