Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP18Q9UMW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP18Q9UMW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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