Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FZD4Q9ULV1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FZD4Q9ULV1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms