Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKLN1Q9UL63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms