Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA3Q9UL41 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms