Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA11Q9UKX5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA11Q9UKX5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms