Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO3Q9UK99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO3Q9UK99 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO3Q9UK99 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms