Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3LQ9UJW3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms