Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAX2Q9UIW0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms