Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEPT3Q9UH03 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEPT3Q9UH03 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms