Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms