Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCL2Q9UBD3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms