Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRP2BPQ9P2M1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRP2BPQ9P2M1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms