Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN3Q9P232 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms