Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO1Q9P1Z2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms