Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SENP1Q9P0U3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SENP1Q9P0U3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms