Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYOFQ9NZM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms