Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIS18AQ9NYP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
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