Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms