Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF2Q9NX18 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDHAF2Q9NX18 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDHAF2Q9NX18 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF2Q9NX18 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms