Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD8Q9NX08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD8Q9NX08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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