Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DCAF13Q9NV06 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms