Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms