Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF19Q9NS68 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms