Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTBP3Q9NS15 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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