Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX15Q9NRS6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX15Q9NRS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms