Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL28Q9NRJ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms