Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR9Q9NR96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR9Q9NR96 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR9Q9NR96 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms