Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GLB2Q9NR46 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GLB2Q9NR46 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GLB2Q9NR46 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GLB2Q9NR46 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GLB2Q9NR46 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GLB2Q9NR46 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms