Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF3Q9NR23 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF3Q9NR23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms