Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPHNQ9NQX3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPHNQ9NQX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms