Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms