Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PFDN4Q9NQP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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