Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB3Q9NPA1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB3Q9NPA1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms