Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSU72Q9NP77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms