Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAVER2Q9HCJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAVER2Q9HCJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms