Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI0

PARVG, Gamma-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVGQ9HBI0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARVGQ9HBI0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARVGQ9HBI0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVGQ9HBI0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms