Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDFQ9HBH1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms