Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC28A3Q9HAS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms