Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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