Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUDS3Q9H7L9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUDS3Q9H7L9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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